Den anställda fick gå från ett säkerhetsklassat jobb på myndigheten på grund av sitt engagemang i Rebellmammorna, som sjunger och stickar för att uppmärksamma klimatfrågan.
När det blev känt att hon var engagerad i rörelsen skrev Bohlin på X att han haft ett samtal med generaldirektören och fått veta att Energimyndigheten hade "hanterat situationen i sak".
Mitt samtal med generaldirektören handlade om deras generella rutiner och hur man säkerställer att man inte hamnar i en situation som liknar den här igen, säger Bohlin i Ekots lördagsintervju.
Miljöpartiet anser att det väcker frågor om han påverkat hur myndigheten hanterat fallet. Om så har skett skulle det strida mot reglerna, och MP och V har KU-anmält Bohlin.
Ministern uppger att han fick okej från klimat- och näringsdepartementet att höra av sig till Energimyndigheten, även om den inte ligger under hans departement.
Jag hade kontakt med klimat- och näringsdepartementet som tillstyrkte att jag talade med deras generaldirektör.
Jag håller inte med om slutsatsen att man inte skulle kunna prata med myndighetschefer eller andra aktörer för att få information, säger han.
Rättad: I en tidigare version av texten förekom en felaktig beskrivning av hur kvinnan fick lämna jobbet.