Segern var KuPS:s fjärde på de senaste fem matcherna.
Tim Väyrynen gjorde två och Taneli Hamalainen ett mål för KuPS.
Med en omgång kvar är KuPS på andra plats i tabellen, medan SJK är på fjärde plats.
Onsdag 22 september 18.30 spelar KuPS borta mot FC Honka. SJK möter FC Inter hemma lördag 18 september 17.00.