Jessie Scarpa blev matchhjälte med sitt avgörande 2-1-mål efter 90 minuter.
Första halvlek blev mållös, men direkt efter pausen slog Amanda Rantanen till och gav KIF Örebro ledningen.
Med en knapp halvtimme kvar att spela fick Emma Lennartson träff och kvitterade för Linköping.
Det matchavgörande målet kom i 90:e minuten, när Jessie Scarpa gjorde 2-1 för KIF Örebro. Det fastställde slutresultatet till 2-1.
KIF Örebro ligger på nionde plats i tabellen efter matchen, medan Linköping är på sjätte plats.
Nästa motstånd för KIF Örebro är Växjö. Lagen möts lördag 4 september 16.00 på Visma Arena.